Kaikki paperittomien ihmisten saapumiset EU:n alueelle eivät ole ns. 'laittomia maahantuloja'. EU:n rajan ylittävien joukossa on myös paljon henkilöitä, jotka ovat  lähtökohtaisesti oikeutettuja kansainväliseen suojeluun. Esimerkiksi monet Kreikan rajan ylittävistä ovat kotoisin Irakista, Somaliasta ja Afganistanista ja siten prima facie oikeutettuja kansainväliseen suojeluun kotimaissaan vallitsevien olosuhteiden vuoksi.
 

RABIT-operaation perimmäisenä tarkoituksena on tukea Kreikkaa maahantulojen hallinnoinnissa. Amnesty International arvostelee sitä, että operaatio voi pahimmillaan  johtaa kansainvälisen suojelun epäämiseen  siihen oikeutetuilta henkilöiltä  tai  jopa myötävaikuttaa palautettuihin maahantulijoihin kohdistuviin ihmisoikeusrikkomuksiin.
 
Julkisuudessa olleiden tietojen mukaan RABIT-operaatiossa pyritään turvaamaan perustavanlaatuiset ihmisoikeudet. Amnestylle on kuitenkin jäänyt epäselväksi, millä tavoin tämä voidaan taata käytännössä. Siksi Amnesty International vaatii, että Kreikkaan matkustavat Suomen viranomaiset etsivät vastauksia seuraaviin kysymyksiin:

• Mitä koulutusta rajavartijoille on annettu, miten he esimerkiksi pystyvät tunnistamaan henkilöt jotka ovat kansainvälisen suojelun tarpeessa? 
• Miten palautuskielto huomiodaan RABIT-operaatiossa?
• Millä tavoin Kreikkaa on tuettu rakentamaan riittävät vastaanottokeskukset?
• Annetaanko UNHCR:n tavata maahantulijoita ja saavatko mahdolliset turvapaikanhakijat oikeudellista neuvontaa?
• Miten operaatioiden riippumaton monitorointi järjestetään?

Nämä kysymykset koskettavat olennaisia  EU:n perusoikeuskirjan takaamia perusoikeuksia; oikeutta hakea turvapaikkaa (18 artikla) ja suojaa palauttamiselta (19 artikla). Jotta palautuskieltoa ei rikota, on jokaisen maahantulijan kohdalla tehtävä riittävä riskianalyysi palautuksesta ja mahdollisesta ketjupalautuksesta. 
 
Ketään ei saa palauttaa sellaiseen maahan,  jossa heille ei voida turvata suojaa palauttamiselta, oikeutta hakea turvapaikkaa ja kansainvälisen oikeuden mukaista kohtelua.

Euroopan unionin perusoikeuskirja sitoo kaikkia EU:n toimielimiä, ml. Frontexia ja sen yhteydessä suoritettavia operaatioita. Siten EU:n rajavalvonnan puitteissa on taattava, että EU:n perusoikeuskirjassa turvatut oikeudet toteutuvat myös EU:n ulkorajoilla.